More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0600 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  100 
 
 		 155 bp  307  5.0000000000000004e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 79 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 79 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 79 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 78 bp  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 79 bp  111  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.21 
 
 		 79 bp  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.21 
 
 		 79 bp  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.21 
 
 		 79 bp  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 79 bp  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 79 bp  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 79 bp  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  8e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 78 bp  87.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>