More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0700 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5029  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0670  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2036  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405552  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 155 bp  89.7  9e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt014  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0404  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000149688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0072  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742395  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0358  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>