More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0052 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  90.62 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000149688  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0072  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742395  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35030  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.838574  normal  0.836072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>