299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0019 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0048  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000535442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0072  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742395  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000149688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>