More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0016  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.230534  normal  0.905617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08220  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.825752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 155 bp  60  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0042  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000217777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0048  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000535442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>