65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08220 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08220  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.825752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0016  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.230534  normal  0.905617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0011  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03610  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0010  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0005  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0027  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000602514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0042  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0002  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0417  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00804447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0264788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0560  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2171  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.100326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0027  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00584174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0176  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>