More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t2171 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0560  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2171  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.100326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0264788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0417  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00804447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0176  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0027  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00584174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0056  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102951  normal  0.0568899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0058  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0059  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.0549747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0057  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102505  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0027  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000602514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1616  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.620085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1581  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>