More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0011 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  87.88 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86.36 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00767918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0069  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000181822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>