60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0050 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0007  tRNA-Thr  94.64 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07560  tRNA-Thr  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.788241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0007  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0056  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0013  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162323  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 67 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0002  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>