99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0044 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309101  tRNA-Thr  97.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309174  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0007  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309133  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0001  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0009  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.59957 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286369  normal  0.0478712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.841782  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>