53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0033 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0042  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  95.45 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0001  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0045  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0035  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.640819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_711  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.016147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0009  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649352 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00560229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0019  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>