295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_R0027 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  98.94 
 
 
94 bp  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0016  tRNA-Ser  98.94 
 
 
94 bp  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.59957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  98.94 
 
 
94 bp  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  98.94 
 
 
94 bp  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  95.74 
 
 
93 bp  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0027  tRNA-Ser  93.62 
 
 
94 bp  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614719  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  91.49 
 
 
94 bp  123  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  88.51 
 
 
94 bp  93.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0056  tRNA-Ser  87.23 
 
 
94 bp  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.124378  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0032  tRNA-Ser  87.37 
 
 
95 bp  85.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0022  tRNA-Ser  87.37 
 
 
95 bp  85.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0021  tRNA-Ser  87.23 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0075  tRNA-Ser  86.17 
 
 
93 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  85.11 
 
 
90 bp  73.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  87.5 
 
 
94 bp  71.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4271  tRNA-Ser  86.36 
 
 
95 bp  71.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  9.700030000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0897  tRNA-Ser  86.36 
 
 
95 bp  71.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  86.17 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  86.17 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0027  tRNA-Ser  86.36 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0072  tRNA-Ser  86.36 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  95.45 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0025  tRNA-Ser  86.36 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  95.45 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0054  tRNA-Ser  86.36 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000379646  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  86.17 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0021  tRNA-Ser  86.36 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.724963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  86.21 
 
 
93 bp  69.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  85.11 
 
 
92 bp  69.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  95.24 
 
 
91 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4560  tRNA-Ser  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0913747  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  93.18 
 
 
88 bp  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  93.18 
 
 
93 bp  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  85.06 
 
 
94 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0043  tRNA-Ser  86.21 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.710531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0033  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.172474  normal  0.681526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  85.06 
 
 
92 bp  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  93.18 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  86.21 
 
 
91 bp  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  85.06 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  61.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  84.04 
 
 
92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  61.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  83.87 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.841782  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0203  tRNA-Ser  85.9 
 
 
93 bp  60  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.829329  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0027  tRNA-Ser  84.15 
 
 
94 bp  60  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  83.87 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  94.74 
 
 
88 bp  60  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286369  normal  0.0478712 
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0008  tRNA-Ser  86.3 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>