278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0059 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  89.33 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  89.33 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309101  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309174  tRNA-Thr  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0007  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251988  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03880  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0309562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>