74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0041 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0011  tRNA-Thr  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0010  tRNA-Thr  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0001  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_326  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00688078  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0007  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000187685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03880  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0309562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35030  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.838574  normal  0.836072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0007  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>