87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_tRNAThrVIMSS1309366 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309174  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309101  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309133  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0023  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0041  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.550306  hitchhiker  0.00560098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0034  tRNA-Thr  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.580916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0011  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0010  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0011  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0011  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0488568  normal  0.109473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>