45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_R0023 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0001  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0078  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0075  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.648131  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0053  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.702685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0017  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395224  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0005  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0055  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0057  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0001  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0002  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0024  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9344  normal  0.172928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0053  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0016  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0005  tRNA-Thr  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0011  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0005    86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>