192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0011 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0013  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000622484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0012  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000141414  hitchhiker  0.00853262 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0008  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0018  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0023  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000013952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0055  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000011398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0070  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0022  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000255037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0091  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.13219e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4474  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000220241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4355  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000300865  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0106  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000701517  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0008  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000148165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0031  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4720  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.2702999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5103  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000647348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0014  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000357359  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0088  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4427  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000793255  hitchhiker  0.0000458064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4696  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.54682e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2802  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000503689  normal  0.100014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>