296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_R0008 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0054  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0055  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0026  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000120513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0004  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0355  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.337369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  87.88 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0018  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4557  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0004  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0130  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000480729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6021  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.893316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t008  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t004  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811739  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0070  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0632642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000937466  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294168  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0124  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0015  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000088003  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0016  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0049  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309202  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.083443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309157  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309113  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309354  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0041  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0007  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.237633  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0031  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0975905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0021  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696816  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0014  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309355  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.824908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309082  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.248116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309081  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0014  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000427945  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3825  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3763  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0056  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0111608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0069  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00993164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3795  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3085  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000338041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0077  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1905  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>