32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0090 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  97.62 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  95.56 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  84.72 
 
 
75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0023  tRNA-Thr  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  88 
 
 
73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.75 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  89.74 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0072  tRNA-Thr  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0031  tRNA-Thr  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0026  tRNA-Thr  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R20  tRNA-Thr  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180694  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t16  tRNA-Thr  86.96 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>