55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_R0054 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0037  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0011  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0027  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0024  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0061  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0042  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00571323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0032  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0007  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00416188  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>