28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_R0011 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  92.21 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>