34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0085 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0442  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0014  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155651  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0019  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>