78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0064 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  98.67 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0052  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0011  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt27  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.938992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0007  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14006  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0190792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0006  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0010  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0024  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000548413  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0006  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0011  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.176514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0013  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00398337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0027  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0037  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.788475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  82.86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>