23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0017 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0016  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0052  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  99.6  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0033  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0003  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.220324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0035  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00189879  hitchhiker  0.0000515743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 109 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0050  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000486604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>