13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0052 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0033  tRNA-Thr  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0003  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.220324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0034  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.580916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>