More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0044 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0068  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0070  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0792206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4492  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0069  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0763001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0121  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000952956  decreased coverage  0.0000866797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>