109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0054 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0007  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0006  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0010  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0006  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14006  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0190792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0012  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0052  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0054  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.788475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21220  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0009  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0052  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0015  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0013  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510336  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0066  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0641093  normal  0.577615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0048  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0073  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.714988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0009  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.170305  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03510  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0017  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0054  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0069  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0009  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0053  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21430  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000055633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0045  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0015  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0050  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.92486  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0042  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000280206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0054  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000720671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0042  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t10  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000121578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0005  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.134807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0016  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000825993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0017  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663854  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0012  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000200408  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0046  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000374178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0044  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2373  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>