247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_R0017 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000374178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663854  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000720671  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t10  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000121578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000200408  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.134807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000825993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0041  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0014  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  97.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0070  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0038  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000920806  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0042  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000280206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0009  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259067  hitchhiker  0.000000000126402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>