65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0064 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0063  tRNA-Thr  100 
 
 		 71 bp  99.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.701304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0061  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0011  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1552  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0041  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0045  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0006  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0007  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0024  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000548413  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0006  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14006  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0190792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0010  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0002  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0036  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000744729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0016  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192488  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0021  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0015  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0033  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>