82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1552 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1552  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0093  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0061  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0012  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0042  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000280206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6035  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0015496  normal  0.392625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0793  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t11  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.089356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0031  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.583187  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_002950  PGt27  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.938992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0037  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00204676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0039  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00777868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0012  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4591  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0012  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.756244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>