298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ala-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  92.54 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  89.39 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  89.39 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.74 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0318084  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0057  tRNA-Ala  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1766  tRNA-Ala  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0045  tRNA-Ala  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0047  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739018  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0076  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0810771  normal  0.223627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  96.77 
 
 
78 bp  54  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0041  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306832 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  96.77 
 
 
73 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>