182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0029 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0001  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0039  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.980011 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0002  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000366023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04940  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.669042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0044  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331518  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0031  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.488566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122889  normal  0.598483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0029  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000441768  normal  0.0859577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0064  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0011    88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0007  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0013  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00398337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0001  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.272552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0002  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0019  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0012  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0065  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0054  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA3  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0002  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0057  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0011  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0269347  normal  0.199214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0049  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0050  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000486604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0038  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000920806  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0004  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0064  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.392789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000174487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>