More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0057 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0047  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0013  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00398337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0059  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0043  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0640693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4330  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0001  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0012  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0089  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0080  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755627  normal  0.408373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0079  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520494  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0013  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0088  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0019  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000697155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000221447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0036  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2546  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0594848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2776  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.453071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0017  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000742006  normal  0.411264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2604  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0335338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0014  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2555  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2775  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000162268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0056  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0039  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000491618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2968  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00156309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000168426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2645  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0670079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2554  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0062  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0060  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00115408  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5048  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000423557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0057  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00550972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0050  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0038  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000499676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0058  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2969  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0013859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2603  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3627  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2669  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2646  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2670  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3626  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0040  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00260551  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2547  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.03374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4597  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0060  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0168409 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  86.96 
 
 		 147 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0051  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0041  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0041  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00270764  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0042  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1766  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla03  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0002  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716765  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0012  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0026  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0027  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.392789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3211  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000354338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>