144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0012 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0023  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309073  tRNA-Ala  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  89.55 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309191  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13041  hypothetical protein  88.06 
 
 		 165 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309346  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.190165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0048  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0037  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.822608  normal  0.125193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0040  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0020  tRNA-OTHER  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0019  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0477959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0012  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0019  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000697155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0038  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0052  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0011  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0011  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14037  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.897629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0399  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000357697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16771  hypothetical protein  93.75 
 
 		 120 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0075  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000858856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0032  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0037  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309258  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000198123  normal  0.111595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599859  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0063  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000680631  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0025  tRNA-Ala  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0011  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0013  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00398337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0039  tRNA-Ala  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575536  normal  0.4318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>