More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2090 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1766  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0045  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0076  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0810771  normal  0.223627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0065  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.485715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08330  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0848374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0048  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.152542 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2834  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000118902  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna086  tRNA-Ala  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000772007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0120  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6015  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01010  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6008  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.458315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0013  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466573  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0040  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>