39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0040 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0020  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0017  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0024  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0513079  normal  0.0822936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0016  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0052  tRNA-Ala  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0029  tRNA-Ala  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0038  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0012  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0011  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0011  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14037  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.897629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0013  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466573  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0025  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0038  tRNA-Ala  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882256  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0045  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.372348 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0023  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0202697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000110801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0002  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.30172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>