More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0031 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0202697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000110801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0055  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.882837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0034  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0029  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0016  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0277  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.5301700000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1915  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000764546  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 155 bp  63.9  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0011  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454361  hitchhiker  0.00914283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3082  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0050  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.142623  normal  0.530513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0386  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0021  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171602  hitchhiker  0.000301734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00100  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0037  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0019  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-2  tRNA-Val  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.410035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-2  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00946418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-4  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-5  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0556  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2175  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.527459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2568  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0023  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0226385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0083  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0172  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0413  tRNA-Val  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.117487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0010  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.451721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0062  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0050  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.721622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0052  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0016  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0037  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.021593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0041  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0260276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0049  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000361087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0079  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0006  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0035  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0071  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0069  tRNA-Val  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000032502  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1352  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000878402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000487057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55634  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62070  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>