299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0002 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0002  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.552178  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  88.16 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1464  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08330  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0848374 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  86.84 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0048  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.152542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  86.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0053  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.4871  normal  0.314649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0015    90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348297  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0027  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285298  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0010  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.021677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0047  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0054  tRNA-Ala  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>