More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0018 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0054  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876029  normal  0.742043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0056  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000771632  normal  0.557555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0002  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 78 bp  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0058  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000693286  normal  0.541415 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t01  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 78 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0220  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000245454  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5026  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000587824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4569  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000675831  normal  0.111562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0787  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3879199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5811  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4995  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5658  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0106  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000506231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0041  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0041  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0196  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0135  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>