73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0051  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0022  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830353  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0011  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03660  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.018948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0014  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0015  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0004  tRNA-Ala  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0006  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0034  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.580916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0006  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0033  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0036  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0015  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0021  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0016  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192488  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0064  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0014  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155651  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24920  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.952959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24910  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>