59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0009 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21220  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0045  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0015  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0066  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0641093  normal  0.577615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0073  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.714988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0009  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.170305  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03510  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0052  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0017  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0069  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0048  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0009  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0015  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0013  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0053  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0054  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0010  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0006  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0006  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0007  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0052  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14006  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0190792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0054  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.788475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0012  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21430  tRNA-Thr  98.21 
 
 		 73 bp  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000055633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0050  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.92486  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0054  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0013  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000622484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0031  tRNA-Thr  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401044  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0044  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2373  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2731  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.264397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2417  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000618371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0080  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0207378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0076  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>