39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0052 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0072  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.01367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0097  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0035  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0022  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0046  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.22296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0041  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0636835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0025  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.156326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0010  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0003  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.070805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>