75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0024 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0024  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000548413  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0022  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0051  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0015  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0036  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0045  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0033  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0041  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0016  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192488  normal  0.776815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0021  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0014  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0052  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0046  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0023  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>