53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0053 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0056  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0014  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0007  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25010  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1366  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0051  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536452  normal  0.0513822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0049  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0574229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14039  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.672342  normal  0.0461777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0053  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0031  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t16  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0026  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0007  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00416188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0072  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0023  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>