298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_R0034 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0062  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269971  normal  0.0642327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0033  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.531493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0020  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0055  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01506  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0031  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0547169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0040  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0040  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0920487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0011  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0710124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0014  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0031  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0799224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0030  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0191215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0031  tRNA-Thr  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0045  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00005  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0298  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0084  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806179  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0071  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0039  tRNA-Thr  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000122131  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0373  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0664005  normal  0.64583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0365  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000585486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0355  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0073  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0026  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0072  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000258619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0202  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0026  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477919  normal  0.0674918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0364  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0289  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.514684  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0358  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4645  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5010  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0042  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00571323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0061  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0032  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0072  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0026  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0031  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t16  tRNA-Thr  89.39 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0024  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0053  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R20  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180694  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0041  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0023  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0045  tRNA-Thr  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0070  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0024  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_002950  PGt27  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.938992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0284  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.359801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5011  tRNA-OTHER  89.13 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0006  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00193537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0007  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00416188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>