27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0012 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0042  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1222  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.335805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3149  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000320663  hitchhiker  0.0000000000372776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1850  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00244712  hitchhiker  0.00000000792688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>