23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0042 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0042  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0849225  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_711  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.016147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0019  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00560229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>