131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0018 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0035  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.367362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0045  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0004  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0018  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000251336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0057  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00765372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0072  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0042  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0042    88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00632518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0026  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219197  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0057  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0043  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0057  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0965803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0039  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.436106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0040  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0009  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0067  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>