56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_R0035 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.367362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0043  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0040  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0057  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0026  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219197  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0042    94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00632518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0003  tRNA-Thr  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.110757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4304  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0028  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.041835  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0073  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0011  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-5  tRNA-Met  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000422709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 399 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0331098  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-8  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000362106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0051  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0408927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>