More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0004 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000251336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0072  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00765372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0057  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0965803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0039  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.436106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0009  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0039  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0019  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0041  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0049  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0043  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0081  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0023  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0068  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0061  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0054  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0037  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0019  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0029  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0042  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344587  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0072  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204663  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0051  tRNA-Ala  93.62 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0056  tRNA-Ala  93.62 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0056  tRNA-Ala  88.89 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0027  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0027  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0013  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0034  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.697663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0020  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0042  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0034  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0021  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905085  normal  0.99602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0019  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0011  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.434197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0040  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0032  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0040  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0011  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176599  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0026  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0015    86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348297  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>